| ซีซั่น 06 | ลำดับตอนเวอร์ชันภาษาไทย |
| ปี 2001 |
| 219 – รวมพลยอดนักสืบ คุโด้ ชินอิจิ ปะทะ จอมโจรคิด (ตอนพิเศษ 2 ชั่วโมง) | ปี 5 EP.235-238 |
| 220 – ผู้จ้างวานที่มีแต่ความเท็จ (ตอนแรก) | ปี 5 EP.239 |
| 221 – ผู้จ้างวานที่มีแต่ความเท็จ (ตอนจบ) | ปี 5 EP.240 |
| 222 – และแล้วนางเงือกก็หายไป (ภาคคดี) | ปี 5 EP.241 |
| 223 – และแล้วนางเงือกก็หายไป (ภาคสันนิษฐาน) | ปี 5 EP.242 |
| 224 – และแล้วนางเงือกก็หายไป (ภาคไขปริศนา) | ปี 5 EP.243 |
| 225 – ความลับของกิจการที่รุ่งเรือง | ปี 5 EP.244 |
| 226 – กับดักเกมต่อสู้ (ตอนแรก) | ปี 5 EP.245 |
| 227 – กับดักเกมต่อสู้ (ตอนจบ) | ปี 5 EP.246 |
| 228 – คดีฆาตกรรมในห้องเรียนเครื่องปั้น (ตอนแรก) | ปี 6 EP.247 |
| 229 – คดีฆาตกรรมในห้องเรียนเครื่องปั้น (ตอนจบ) | ปี 6 EP.248 |
| 230 – ผู้โดยสารปริศนา (ตอนแรก) | ปี 6 EP.249 |
| 231 – ผู้โดยสารปริศนา (ตอนจบ) | ปี 6 EP.250 |
| 232 – คดีตกจากแมนชัน | ปี 6 EP.251 |
| 233 – หลักฐานที่ไม่หายไป (ตอนแรก) | ปี 6 EP.252 |
| 234 – หลักฐานที่ไม่หายไป (ตอนจบ) | ปี 6 EP.253 |
| 235 – ห้องเก็บไวน์ที่ปิดตาย | ปี 6 EP.254 |
| 236 – ทัวร์พิศวงนันกิชิราฮามะ (ตอนแรก) | ปี 6 EP.255 |
| 237 – ทัวร์พิศวงนันกิชิราฮามะ (ตอนจบ) | ปี 6 EP.256 |
| 238 – คดี 3K ที่โอซาก้า (ตอนแรก) | ปี 6 EP.257 |
| 239 – คดี 3K ที่โอซาก้า (ตอนจบ) | ปี 6 EP.258 |
| 240 – คดีคุมตัวผู้ต้องหาในชินคันเซ็น (ตอนแรก) | ปี 6 EP.259 |
| 241 – คดีคุมตัวผู้ต้องหาในชินคันเซ็น (ตอนจบ) | ปี 6 EP.260 |
| 242 – วิกฤติของเก็นตะ | ปี 6 EP.261 |
| 243 – โมริ โคโกโร่ตัวปลอม (ตอนแรก) | ปี 6 EP.262 |
| 244 – โมริ โคโกโร่ตัวปลอม (ตอนจบ) | ปี 6 EP.263 |
| 245 – เสียงปืนในคฤหาสน์ทานตะวัน | ปี 6 EP.264 |
| 246 – ปริศนาที่ติดอยู่ในร่างแห (ตอนแรก) | ปี 6 EP.265 |
| 247 – ปริศนาที่ติดอยู่ในร่างแห (ตอนจบ) | ปี 6 EP.266 |
| 248 – หลักฐานในป่าแห่งการเยียวยา | ปี 6 EP.267 |
| 249 – ความลับของเหล่าไอดอล (ตอนแรก) | ปี 6 EP.268 |
| 250 – ความลับของเหล่าไอดอล (ตอนจบ) | ปี 6 EP.269 |
| 251 – โศกนาฏกรรมที่คอกม้า OK | ปี 6 EP.270 |
| 252 – โจรเรียกค่าไถ่ในภาพวาด | ปี 6 EP.271 |
| 253 – นิยายรักตำรวจนครบาล ภาค 4 (ตอนแรก) | ปี 6 EP.272 |
| 254 – นิยายรักตำรวจนครบาล ภาค 4 (ตอนจบ) | ปี 6 EP.273 |
| 255 – แข่งต่อโคลง 14 บท ที่มัตสึเอะทามะสิคุริ (ตอนแรก) | ปี 6 EP.274 |
| 256 – แข่งต่อโคลง 14 บท ที่มัตสึเอะทามะสิคุริ (ตอนจบ) | ปี 6 EP.275 |
| 257 – โทษทัณฑ์ประหลาดแบบนี้ก็มีด้วย | ปี 6 EP.276 |
| 258 – บุรุษผู้มาจากชิคาโก้ (ตอนแรก) | ปี 6 EP.277 |
| 259 – บุรุษผู้มาจากชิคาโก้ (ตอนจบ) | ปี 6 EP.278 |
| 260 – ภัตตาคารที่สั่นคลอน | ปี 6 EP.279 |
| 261 – ตำนานสยองในคืนหิมะตก (ตอนแรก) | ปี 6 EP.280 |
| 262 – ตำนานสยองในคืนหิมะตก (ตอนจบ) | ปี 6 EP.281 |
