| 008 (008) | |
 | คดีฆาตกรรมเจ้าของหอศิลป์ |
| 020 (021) | |
 | คดีฆาตกรรมในบ้านผีสิง |
| 034-035 (035-036) | |
 | คดีฆาตกรรมซ่อนเงื่อน |
| 050 (051) | |
 | คดีฆาตกรรมในห้องสมุด |
| 052 (053-054) | |
 | คดีฆาตกรรมตำนานคิริเทนงู (ตอนพิเศษ 1 ชั่วโมง) |
| 061-062 (063-064) | |
 | คดีฆาตกรรมเรือผีสิง |
| 074 (076) | |
 | คดีฆาตกรรมยมทูตจินใน |
| 088-089 (091-092) | |
 | คดีฆาตกรรมปราสาทแดร็คคูล่า |
| 136-137 (146-147) | |
 | คดีสำรวจปราสาทโบราณ |
| 166-168 (177-179) | |
 | อาถรรพณ์บ้านแมงมุมที่ทตโทริ |
| 184 (198-199) | |
 | หน้ากากต้องสาปกำลังหัวเราะอย่างเลือดเย็น |
| 222-224 (241-243) | |
 | และแล้วนางเงือกก็หายไป |
| 243-244 (262-263) | |
 | โมริ โคโกโร่ตัวปลอม |
| 274-275 (296-297) | |
 | ความจริงของบ้านผีสิง |
| 291-293 (313-315) | |
 | เจ้าหญิงแห่งเกาะร้างกับปราสาทมังกร |
| 345 (371-375) | |
 | ปะทะองค์กรชุดดำ ปริศนาคูณสองในคืนเดือนเพ็ญ |
| 481-482 (524-525) | |
 | มีดของแม่มดภูเขา |
| 490 (536-537) | |
 | ฮัตโตริ เฮย์จิ ปะทะ คุโด้ ชินอิจิ แข่งคลี่คลายคดีที่ลานสกี |
| 516-517 (564-566) | |
 | ฟุรินคะซัน นักรบชุดเกราะในเขาวงกต ศึกตัดสินระหว่างเงาและสายฟ้า |
| 521-523 (570-574) | |
 | ฆาตกรคือ คุโด้ ชินอิจิ ตัวจริงของชินอิจิ และน้ำตาของรัน เรื่องที่อยากถามจริงๆ |
| 530-531 (581-582) | |
 | ตัวจริงของตำนานเมือง |
| 545-546 (596-597) | |
 | แม่มดในม่านหมอก |
| 600-601 (651-652) | |
 | ความฝันของคับปะ |
| 603-605 (654-656) | |
 | พิธีเชิญวิญญาณและคดีฆาตกรรมในห้องปิดตาย |
| 611-613 (662-663) | |
 | สุนัขปีศาจเปลวเพลิงแห่งปราสาทอินุบุชิ |
| 625-626 (676-677) | |
 | เสียงกรีดร้องจากห้องผ่าตัด |
| 712-715 (764-767) | |
 | ฮัตโตริ เฮย์จิ กับคฤหาสน์ผีดูดเลือด |
| 754-756 (807-759) | |
 | โศกนาฏกรรมสตรีสีชาด |
| 806-807 (861-862) | |
 | มายาของนักพากย์ตุ๊กตา |
| 830-832 (885-887) | |
 | บ้านพักตากอากาศที่ถูกล้อมด้วยซอมบี้ |
| 872-974 (927-929) | |
 | ตำนานนูเอะของโคนันกับเฮย์จิ |
| 847-848 (902-903) | |
 | คดี UFO ของหมวดชิบะ |
| 889-890 (944-945) | |
 | คดีโครงกระดูกของครูคนใหม่ |
| 1039 (1096) | |
 | ฟักทองฮาโลวีนลอยฟ้า |
หมายเหตุ : เลขตอนด้านหน้าเป็นเลขตอนตามต้นฉบับญี่ปุ่น และเลขตอนในวงเล็บเป็นเลขตอนเวอร์ชันไทย